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Discovery Studio 是一款面向生命科学领域的新一代分子建模和模拟环境。软件整合了广泛的资讯学、分子模型建造和模拟工具,应用于蛋白质体、标靶药物开发过程与研究,为科学家提供易用的蛋白质序列比对、优化、结构药物设计工具。
生物大分子:蛋白/核酸的序列分析、蛋白进化分析、蛋白质三维结构的预测与模拟、蛋白质结构表面电荷分析及pKa值预测、膜蛋白的结构预测与模拟、抗体结构的预测与模拟、蛋白理性设计、虚拟氨基酸突变、二硫键预测、虚拟丙氨酸扫描、虚拟饱和突变、蛋白聚集效应预测、抗体的设计与优化、抗体人源化、抗体亲和力成熟、酶的设计与优化、核酸的设计与模拟、蛋白-蛋白(核酸/多肽)相互作用预测、蛋白-小分子相互作用预测、X-ray晶体结构解析等;
计算化学:分子力学计算和分子动力学模拟、拉伸分子动力学模拟、量子力学/分子力学(QM/MM)计算等;
基于靶标结构药物设计:基于靶标结构的化合物虚拟筛选、全新药物设计、me too/me better药物设计、药靶作用机制解释、分子对接、基于片段的药物设计与改造等;
基于配体药物设计部分:完全基于配体的药效团设计、基于配体-受体复合物的药效团设计、化合物数据库的构建和筛选、药效团数据库的构建与保存、基于药效团数据库的反向找靶、定量构效关系分析(QSAR/QSPR)、构效关系分析(MMP)、虚拟组合化学库的设计与分析、类药性筛选、化合物构象搜索和分析、化合物ADMET性质预测等。
使用CHARMm c41b1进行分子力学(MM)计算
支持广泛的电源领域,包括CGenFF,charmm36,charmm27,charmm22,CHARMm,CHARMm-polarH,CFF,MMFF等。
完全支持CHARMM分区机制并支持自定义无效定义
使用天生的CHARMm溶剂模型(GB)快速准确地电离蛋白质和残余pKs。
饮用水的快速溶剂,具有适用于非常大分子系统的可选抗离子
根据国标执行任何溶剂明确或最小化溶剂基分子力学(MM)
基于溶剂进行明确的溶剂或分子动力学模拟
为蛋白质结构添加隐含膜,以便您可以基于场强制定模拟模型。
使用基于CHARMm的对接引擎CDOCKER来执行基于配体的配体结合和精炼对接。
1、下载并安装原程序,复制msi.lic许可证文件到如下路径中
C:Program Files (x86)AccelrysLicensePackLicenses
C:Program Files (x86)AccelrysLicensePacksharedata
C:Program Files (x86)AccelrysLicensePackwin32bin
4、破解完成,打开Web控制端,可以根据需要安装应用,可安装的应用包括
BIOVIA Draw
Data Source Builder
Discovery Studio
BIOVIA Plugin
比如安装Discovery Studio,直接点击Install Discovery Studio,即可下载安装程序
6、如果需要登陆管理员,输入账号密码登陆即可
账号和密码见于压缩包内的Readme.txt
标签: Discovery Studio 分子模型
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